醋酸钠生产厂家生产的醋酸钠作为碳源时其反硝化速率要远高于甲醇和淀粉。其主要原因在于，醋酸钠生产厂家生产的醋酸钠为低分子有机酸盐，容易被微生物利用。而淀粉等高分子的糖类物质需转化成乙酸、甲酸、丙酸等低分子有机酸等最易降解的有机物，然后才被利用。
甲醇虽然是快速易生物降解的有机物，但甲醇必须转化成乙酸等低分子有机酸才能被微生物利用，所以出现了利用醋酸钠作为碳源比用淀粉、甲醇进行反硝化速度快很多的现象 。
甲醇作为一种易燃易爆的危险品，当采用甲醇作为外加碳源时，其本身具有一定的火灾危险性。当甲醇储罐发生火灾时，易导致储罐破裂或发生突沸，使液体外溢发生连续性火灾爆炸，危及范围较大，因此甲醇加药间对周边环境要求一定的安全距离。同时由于其挥发蒸汽与空气混合易形成爆炸性气体混合物，故其范围内的电力装置均须采用特殊设计。
醋酸钠本身不属于危险品，方便运输及储存，绝对价格也比甲醇便宜，因此对于一些已建的污水处理厂来说，由于其用地限制，当需要外加碳源时，采用醋酸钠生产厂家生产的醋酸钠作为外加碳源比甲醇更具有优势。
